Кого ищем
Ищем практикующего биоинформатика по NGS и omics, который умеет строить воспроизводимые пайплайны анализа секвенирования: от сырого FASTQ до биологической интерпретации результата.
Обязательно
- FASTQ QC: FastQC, MultiQC
- trimming и фильтрация: Trimmomatic, fastp, Cutadapt
- выравнивание: BWA, Bowtie2, STAR, HISAT2
- форматы BAM/SAM, VCF, BED, GTF/GFF
- variant calling: GATK, bcftools, samtools
- RNA-Seq: count matrices, DESeq2/edgeR, дифференциальная экспрессия
- scRNA-Seq: Seurat или scanpy, кластеризация, UMAP/t-SNE, аннотация клеток
- metagenomics: Kraken2, MetaPhlAn, HUMAnN или аналоги
- workflow-инструменты: Snakemake, Nextflow, Conda/Docker
Будет плюсом
- cloud/HPC для NGS
- long-read sequencing: PacBio, Oxford Nanopore
- сборка генома: SPAdes, Flye, Canu
- аннотация: Prokka, eggNOG, InterProScan
- клиническая геномика и интерпретация вариантов
- multi-omics integration
Инструменты
FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, BWA, Bowtie2, samtools, bcftools, GATK, DESeq2, edgeR, Seurat, scanpy, Kraken2, MetaPhlAn, SPAdes, Prokka, Snakemake, Nextflow, Docker, Conda.
Что особенно ценим
Ценим реальные NGS-проекты (RNA-Seq, exome, WGS, scRNA-Seq, metagenomics), умение строить воспроизводимый пайплайн, опыт интерпретации результатов для биологов и медиков, а также работу с большими файлами на сервере или HPC.
Похожие вакансии
Практический опыт работы с Google Ads, Meta Ads. Опыт продвижения B2B-проектов. Опыт работы с международными рынками.
Практический опыт SEO-продвижения под Google. Опыт работы с русскоязычными и англоязычными сайтами. Опыт проведения технических SEO-аудитов.
Опыт и подтвержденные кейсы, наличие опыта в схожей сфере будет большим преимуществом. Готовность работать по системе оплаты фикс + KPI...
Опыт от 3-х лет в сфере охраны труда (желательно — работа с торговыми/складскими/офисными организациями). Готовность работать на аутсорсе.
Опыт работы в ВЭД от 3 лет. - Опыт работы с Китаем обязателен. - Знание кодов ТН ВЭД и практика классификации товаров. -
