- Анализ обработанных геномных данных: более 3000 соматических и 6000 герминальных образцов, включая панели, экзомы и транскриптомные данные;
- Работа с вариантами, CNV, клиническими аннотациями, метаданными и результатами автоматической интерпретации;
- Статистическая обработка данных, проверка гипотез, поиск закономерностей, артефактов и выбросов;
- Подготовка графиков, таблиц, аналитических сводок и отчетов;
- Проверка, сравнение и валидация результатов существующих NGS-пайплайнов;
- Участие в описании логики пайплайнов, критериев фильтрации и аналитических ограничений;
- Участие в публикациях, тезисах и научных проектах.
Требования:
Профессиональные навыки
Будет полезен опыт работы с:
- Python: pandas, numpy, scipy, matplotlib, seaborn, plotly, scikit-learn, statsmodels, pysam, cyvcf2, biopython, liftover / pyliftover;
- R: tidyverse, ggplot2, data.table, ComplexHeatmap, survival;
- SQL, желательно PostgreSQL;
- Геномными данными: VCF, CNV, аннотация вариантов, онкогенетические панели, экзомные данные;
- Методами статистического анализа и визуализации данных;
- Основами молекулярной биологии, онкогенетики и клинической интерпретации вариантов.
Личные и командные качества
- Самостоятельность и аналитическое мышление;
- Критичное отношение к результатам автоматического анализа;
- Умение ясно объяснять результаты коллегам с разным уровнем технической подготовки;
- Способность описывать сложные аналитические результаты понятным языком;
Готовность быстро переключаться между исследовательскими, аналитическими и прикладными задачами
Условия:- работа в Молекулярно-генетической лаборатории
- трудоустройство согласно ТК РФ
Похожие вакансии
Опыт работы в роли системного аналитика от 2-х лет. Опыт самостоятельного сбора и анализа как функциональных, так и технических...
Высшее физико-математическое / техническое образование. Опыт разработки на Python. Уверенное владение Python-библиотеками: pandas, numpy, matplotlib. Хорошее знание SQL.
Опыт работы системным аналитиком от 2 лет. Опыт проектирования и анализа автоматизированных систем. Знание методологий анализа и моделирования бизнес-процессов...
Высшее образование (бакалавриат). Продвинутый уровень владения Excel, базовое знание SQL желательно. Понимание принципов работы системы BI. Знание систем управления базами...
Релевантный опыт работы от 3-х лет. Опыт работы в автомобильном бизнесе является преимуществом. Высшее образование в сфере экономики и...
